林正英是在45岁那年去世的。
1997年，林正英本来打算为亚视拍《僵尸道长Ⅲ》，这时候得到消息自己患上肝癌（拍片过度劳累，平时喜爱喝酒）。林正英仍然带病坚持演戏，与徐锦江、刘松仁共同拍摄了最后一部作品，同年11月8日，林正英在香港九龙圣德肋撒医院与世长辞，终年45岁。
林正英生前要求办一个低调的葬礼，因此葬礼仅有他的父母、家人和朋友出席。1997年11月13日晚7点，丧礼举行了佛教仪式；出殡时，杨绍鸿、钱月笙、Ng Ming Hoi、Lam King Chu、陈会毅、钟发、洪金宝、陈永康、钱嘉乐、午马10人为其扶灵。之后，林正英的遗体被火化并在美国埋葬，而林正英生前的长袍、鞋子和帽子以及其最喜欢的衣服和太阳镜也被一同埋葬。
